Mostrar el registro sencillo del ítem
dc.date.accessioned | 2024-11-16T02:06:32Z | |
dc.date.available | 2024-11-16T02:06:32Z | |
dc.date.issued | 2024-11-15 | |
dc.identifier.uri | https://github.com/tnavarrofebre/ShellsPathwayMD/tree/main/tests/NaCl_tests_box | |
dc.identifier.uri | http://redi.exactas.unlpam.edu.ar/xmlui/handle/2013/388 | |
dc.description | Este repositorio contiene archivos de simulación de dinámica molecular generados con GROMACS para una caja que simula una solución de cloruro de sodio (NaCl) en agua. La caja tiene dimensiones de 4 nm x 4 nm x 8 nm y está compuesta por 4231 moléculas de agua SPCE, junto con 16 iones de sodio (Na) y 16 iones de cloro (Cl), de los cuales 8 Na y 8 Cl están restringidos sobre dos caras adyacentes, mientras que los demás son móviles. La simulación se realiza a 300K y 1 atm, usando el modelo de fuerza AMBER99 para representar las interacciones moleculares. Los archivos .gro contienen la configuración inicial de los átomos, los archivos .xtc almacenan las trayectorias de la simulación, y el archivo .ndx define grupos de átomos para análisis posteriores, como la función de distribución radial (RDF) y otros cálculos de coordinación atómica. | es |
dc.language.iso | en | es |
dc.subject | Átomos de referencia | es |
dc.subject | GROMACS | es |
dc.subject | Dinámica molecular | es |
dc.subject | Análisis de trayectorias | es |
dc.title | NaCl_text_box | es |
dc.type | Dataset | es |